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2023年8月11日更新
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亞當是基因組數據處理庫在Apache火花。是用來實現管道操作基因如BAM讀取數據,薩姆和補習的文件。
用亞當在磚:
啟動一個磚與這些集群運行時火花配置:
# Hadoop配置org.apache.spark.serializer.KryoSerializerspark.kryo.registrator org.bdgenomics.adam.serialization.ADAMKryoRegistratorspark.hadoop.hadoopbam.bam。enable-bai-splitter真實
安裝集群庫:
Maven:org.bdgenomics.adam: adam-apis-spark3_2.12: <版本>
org.bdgenomics.adam: adam-apis-spark3_2.12: <版本>
PyPI:bdgenomics.adam
bdgenomics.adam