磚的運行時7.3 LTS基因組學(不支持)

磚2020年9月發布了這張照片。它實際上是長期支持(LTS) 2020年10月。

磚的運行時7.3 LTS基因組學是一個版本的磚運行時7.3 LTS針對處理基因組和生物醫學數據進行了優化。它是一個組件的磚統一為基因組學分析平台。Beplay体育安卓版本

重要的

這個文檔已經退休了,可能不會被更新。產品、服務或技術中提到的這些內容不再支持。

磚基因組學的運行時已被棄用。開源的等價物,看到回購genomics-pipelines和發光。生物信息學庫是運行時的一部分被釋放集裝箱碼頭工人,可從ProjectGlow Dockerhub頁麵。

關於磚運行時棄用策略的更多信息和時間表,看看磚運行時版本和支持計劃的支持。

更多信息,包括指令創建磚基因集群,運行時看到的基因組學導遊。關於開發基因組學應用程序的更多信息,請參閱基因組學導遊。

尋求幫助從磚遷移運行時6。x磚LTS 7.3運行時,看到的磚運行時7。x遷移指南。

新功能

磚的運行時7.3 LTS基因組學是建立在運行時7.3 LTS磚。在磚有什麼新信息運行時7.3 LTS,看到磚運行時7.3 LTS發行說明。

現在支持發光閱讀BGEN文件包含SNP概率數據塊壓縮或使用zstandard的壓縮ZSTD_compress ()功能,除了現有的支持使用zlib壓縮讀取數據壓縮()函數。

執行變體liftOver與發光現在快12倍。

寫大文件(如VCF BGEN和BAM)Azure Blob文件係統現在快2倍。

現在所有的基因組學管道默認壓縮輸出使用bgzip vcf。默認輸出vcf以前未壓縮的。配置這個,改變vcfCompressionCodec管道的選擇從bgzf。

的腫瘤/正常管道已經從TNSeq MutSeq。重命名

下麵列表中包含的庫磚運行時的基因不同於那些包含在7.3 LTS磚7.3運行時。